Pode sim! Para isso, você precisa:
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Desmarcar a opção "Versão Impressa"
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Marcar ( e/ou confirmar que está marcada) a opção "Ebook na etapa 1 de publicação:

Também é importante lembrar que:
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Publicando somente em ebook, você ainda precisa enviar uma capa, a qual servirá para criar o anúncio do livro no site do Clube e nos parceiros.
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O valor mínimo é de R$ 23,63, compreendendo o custo de manutenção e impostos de venda.
Sucesso com sua obra!